El curso de doctorado en ingeniería industrial en la Universidad Federal de Bahía (UFBA) tuvo su origen ideológico en 2004 en el seno de parte de su grupo actual de profesores, como una forma de viabilizar la creación del primer doctorado en ingeniería en la Escuela Politécnica de la UFBA. A principios de 2005, este grupo de profesores de la Escuela Politécnica (EP), con una fuerte vocación por la aplicación de la investigación científica y tecnológica en problemas industriales, preparó el proyecto del Programa, que reunió a profesores de esta escuela con tales características, aliados a una producción científica y tecnológica significativa. En 2006, el proyecto de doctorado en Ingeniería Industrial fue presentado y aprobado por la Coordinación de Perfeccionamiento del Personal de Nivel Superior (CAPES). Durante este período (2004-2006), los docentes del futuro Programa elaboraron y aprobaron varios proyectos para apoyar el fortalecimiento de la Infraestructura y dar soporte a la iniciativa, siendo aprobados y aplicados recursos del orden de 1.5 millones de reales para este fin específico con financiamiento del Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq) y de la Fundación de Apoyo a la Investigación del Estado de Bahía (FAPESB).
El curso de doctorado en Ingeniería Industrial comenzó en el segundo semestre de 2007, con la entrada de 13 estudiantes, y 13 estudiantes más fueron seleccionados para ingresar en el primer semestre de 2008. Además de dar inicio a su funcionamiento y consolidación, el año 2007 estuvo marcado por una serie de iniciativas de crecimiento del Programa y de colaboración del Programa de Post Grado de Ingeniería Industrial (PEI) en el sentido de consolidar y fortalecer los estudios de posgrado en la Escuela Politécnica de la UFBA como un todo. De esta forma, merecen destacarse las siguientes acciones:
Incorporación al Programa de 3 cursos de especialización “lato sensu” ya existentes en la Unidad, con total adhesión a las líneas de investigación y enfoques del Programa, y coordinados por profesores vinculados al PEI, a saber: Curso de Especialización en Automatización Industrial con énfasis en Informática, Instrumentación, control y optimización de procesos continuos (CICOP); Curso de Especialización en Ingeniería de Gas Natural (CEEGAN); Curso de Especialización en Gestión y Tecnologías Ambientales en el proceso productivo – Con énfasis en Producción Limpia (TECLIM-ESP);
- Creación del Curso de Especialización en Ingeniería Económica, Estrategia y Prevención de Pérdidas en la Industria (CEPI);
- Preparación de proyectos y presentación a la CAPES de las Maestrías Académica y Profesional en Ingeniería Industrial, con la incorporación de la Maestría Profesional en Gestión y Tecnologías Ambientales en el Proceso de Producción (MEPLIM) al PEI.
El año 2008 comprendió inicialmente la incorporación de MEPLIM, que ahora es gerenciada administrativa y pedagógicamente por el PEI, que absorbió de esta forma toda la historia y los encargos de este curso hasta el año 2009, cuando se realizaron las últimas defensas de disertación. El 16/09/2008, los cursos de Maestría Académica y Profesional en Ingeniería Industrial fueron aprobados por el Consejo Técnico Científico (CTC) de la CAPES. Dada la significativa demanda de la comunidad local, el curso de Maestría Académica en Ingeniería Industrial completó su primera selección, con la inscripción de 10 estudiantes regulares, ya el 10/10/2008 y las actividades del curso, por lo tanto, comenzaron en octubre 2008. En agosto de 2009 tuvimos el comienzo del primer grupo del curso de la Maestría Profesional.
En el año 2009, en su segundo año de existencia, el PEI realizó su primera defensa de tesis doctoral, o primer documento de conclusión referente al curso de doctorado, presentado por la estudiante Gloria Meyberg Nunes Costa, realizada el 25 de septiembre de 2009.
En el año 2010, antes de que el Máster Académico completara el segundo año, el PEI tuvo su primera disertación de defensa, presentada por el estudiante Márcio André Fernandes Martins, el 8 de julio de 2010.