Historicamente, o Programa de Pós-graduação em Engenharia Industrial (PEI: www.pei.ufba.br) da Universidade Federal da Bahia foi recomendado pela CAPES em 26 de novembro de 2006, 70 anos após a fundação da UFBA, ocorrida em 1946. Ao iniciar suas atividades no ano seguinte, coincidiu com a celebração dos 110 da fundação da Escola Politechnica da Bahia, ocorrida em 1897. Um dos fundadores da antiga Politechnica, o engenheiro civil, jornalista e político brasileiro Arlindo Coelho Fragoso (1865 - 1926), havia determinado já no primeiro Regimento desta instituição, por ter sido seu primeiro diretor, o que segue: “Art. 1º: O ensino ministrado na Escola Polytechnica da Bahia será actualmente o do curso de Engenharia Civil, podendo posteriormente ser criados os cursos de Engenharia Mecanica e de Eletricidade, de Engenharia Industrial, de Engenharia Agronômica e outros cursos profissionais”. Depreende-se, portanto, a necessidade, desde a fundação da primeira escola de engenharia do Estado da Bahia, de um planejamento para o que se convencionou chamar de Engenharia Industrial, fato apenas consumado através de um curso de pós-graduação mais de um século depois.
De fato, primeiro foi instalado o curso de Doutorado em Engenharia Industrial, que teve o seu início no segundo semestre de 2007, com a entrada de 10 discentes, tendo sido selecionados mais 10 estudantes para entrada no primeiro semestre de 2008, o que demonstra o impacto positivo que o Programa representou junto à comunidade quando iniciado. O ano de 2008 compreendeu também a evolução do curso de doutorado, com o ingresso de 10 alunos regulares no primeiro semestre e de 6 alunos regulares no segundo semestre. Em 16/09/2008, os cursos de Mestrado Acadêmico e Profissional em Engenharia Industrial foram aprovados pelo CTC/CAPES. Dada a significativa demanda da comunidade local, o curso de Mestrado Acadêmico em Engenharia Industrial concluiu sua primeira seleção, com o ingresso de 10 alunos regulares, já em 10/10/2008 e as atividades deste curso se iniciaram ainda em outubro de 2008.
De acordo com as expectativas, o primeiro triênio do Programa (2007-2009) foi um triênio de consolidação dos cursos de Doutorado e de Mestrado (principalmente o Mestrado Acadêmico), com o estabelecimento de uma demanda de ingresso de alunos regulares e do desenvolvimento das primeiras teses e dissertações. O Programa concluiu o período 2007-2009 com um total de 39 alunos regulares de Doutorado (mais 3 titulados) e 25 alunos regulares de Mestrado Acadêmico. Em agosto de 2009 tivemos o início da primeira turma do curso de Mestrado Profissional em Engenharia Industrial (MPEI), havendo a seleção de 2 alunos regulares de um total de 5 candidatos, somando-se a outros 13 alunos veteranos do antigo MEPLIM
Em 2009, já no seu terceiro ano de existência, o PEI teve as suas 3 primeiras defesas de tese de doutoramento, que foram também as primeiras defesas de doutorado em engenharia do Estado da Bahia, representando, portanto, um marco importante para a história e as perspectivas da ciência e da tecnologia no Estado e revelando o impacto e a visibilidade do PEI, sobretudo no âmbito regional, mas também nacional.
Em 2010, tivemos a primeira defesa de dissertação do curso de mestrado acadêmico em engenharia industrial, realizada pelo aluno Marcio André Fernandes Martins, atualmente docente permanente do PEI. Foi atribuída ao aluno a menção de ‘aprovado por distinção’, sustentada pelo fato de que ele atendeu plenamente aos requisitos exigidos pelo Programa para a obtenção deste resultado.
A consolidação de um número significativo de defesas de mestrado e de doutorado ao longo do biênio 2011-2012, a manutenção da produção científica qualificada em patamar bastante satisfatório e o expressivo aumento do percentual de docentes com bolsa de produtividade CNPq foram decisivos para que o PEI, já em sua segunda avaliação trienal, obtivesse o conceito 5 (cinco). Já nesta época, o PEI se configurava como o primeiro e único Programa da grande área de Engenharias, no Estado da Bahia, a alcançar conceito 5.