As fontes de financiamento dos cursos tradicionais (strictu sensu), Doutorado e Mestrado acadêmicos, provém majoritariamente de recursos do Ministério da Educação e da CAPES como o PROAP (Programa de Apoio à Pós-Graduação) na forma de recursos por meio de bolsas, além de auxílios à discentes e docentes em missões de trabalho e estudos. Estas são distribuídas anualmente via Pro-Reitoria de Pós-graduação da universidade.
Além da CAPES, o CNPq tem aportado recursos no Programa através de editais institucionais e incentivos a pesquisa por projetos individuais dos pesquisadores. Algumas empresas também aportam recursos para Pesquisa no Programa, como: Petrogal, Petrobrás, Ford, Braskem, Fundação Itaú.